Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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