Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ALCAMQ13740 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms