Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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