Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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