Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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