Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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