Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRFP10586 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRFP10586 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRFP10586 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRFP10586 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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