Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPRCP08575 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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