Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
B4DXG7 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms