Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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