Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LEMD1-201ENST00000367149 604 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 FAM218BP-201ENST00000408897 458 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 OR4A11P-201ENST00000529557 906 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 EIF4A1P4-201ENST00000550578 1213 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 IGHV1OR15-4-201ENST00000560037 348 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC007785.1-201ENST00000597989 332 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC134981.1-201ENST00000628076 348 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P16-201ENST00000452798 171 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC090193.2-201ENST00000518970 537 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms