Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NWD1-201ENST00000379808 7254 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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