Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
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