Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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