Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms