Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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