Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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RNF17Q9BXT8 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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RNF17Q9BXT8 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RNF17Q9BXT8 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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