Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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RAB6CQ53S08 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RAB6CQ53S08 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RAB6CQ53S08 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RAB6CQ53S08 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RAB6CQ53S08 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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