Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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