Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USF2Q15853 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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