Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OTOF-201ENST00000272371 7156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TMEM51-AS1-201ENST00000310916 7100 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MAST4-203ENST00000403666 7586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms