Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms