Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms