Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02292-201ENST00000554522 1701 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 STEAP3-AS1-201ENST00000454260 3218 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL133387.3-201ENST00000450669 522 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC020636.1-201ENST00000469268 565 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP000445.1-201ENST00000526692 741 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HEPACAM2-203ENST00000440868 2060 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FASTKD2-202ENST00000402774 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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