Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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