Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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