Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC036222.1-201ENST00000579972 701 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms