Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms