Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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CTSSP25774 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTSSP25774 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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