Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PCDH11Y-202ENST00000333703 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AR-201ENST00000374690 10652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZBTB39-201ENST00000300101 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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LAMA3Q16787 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AP000892.3-201ENST00000624094 5326 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LAMA3Q16787 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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