Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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