Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms