Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC008507.5-201ENST00000624591 1969 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PDE4DIPP1-201ENST00000420737 1641 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 NPHP1-207ENST00000445609 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC003958.2-202ENST00000432258 3890 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 Z83847.1-201ENST00000569912 1463 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 SPDYE11-203ENST00000573748 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SPDYE10P-201ENST00000576332 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 L3MBTL3-202ENST00000368136 4235 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TNNT3-202ENST00000344578 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 IL37-205ENST00000353225 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 UCMA-201ENST00000378681 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TNNT3-205ENST00000381563 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TNNT3-208ENST00000397301 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TNNT3-209ENST00000397304 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 GJA1P1-201ENST00000511478 1143 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 DYDC2-207ENST00000616870 1723 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SLAMF7-202ENST00000368042 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 A4GNT-201ENST00000236709 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FCGR2A-201ENST00000271450 2412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TMEM108-AS1-202ENST00000505721 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL360294.1-201ENST00000640945 2438 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC092683.1-204ENST00000610408 2830 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC159540.2-202ENST00000613749 2830 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC01660-204ENST00000619172 3572 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TMEM241-201ENST00000383233 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZNF23-202ENST00000358700 2692 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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