Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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