Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 HSPD1P5-201ENST00000511127 1720 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 FGA-202ENST00000403106 2248 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 LNP1-203ENST00000489752 1813 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CLN3Q13286 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL3P10-201ENST00000476002 1164 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 AC104063.1-201ENST00000504840 702 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IL2RA-202ENST00000379954 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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