Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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