Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms