Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PIK3CBP42338 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms