Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms