Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms