Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms