Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms