Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms