Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms