Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED23Q9ULK4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED23Q9ULK4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms