Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1Q9UJ41 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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