Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms