Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms