Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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