Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DBF4Q9UBU7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms